而后，刘君韬便命令山东总督胡德兴、太原镇总兵官严虎率军巡视京畿各处，特别是派兵将这十七名将领所部监控了起来，开始对这些兵马进行为期三个月的整训。

这些兵马或是打散重新整编，或是直接并入其他部队，或是军中的主要将领全部撤换。

而对于其余的京畿驻军，刘君韬也没有松懈，以兵部的名义下令：京畿地区各军镇、各城内的驻军将领，凡是游击将军以上的，全部交接兵权，将兵马暂时移交给兵部派来的天策军将领统领，而后便南下赶往山东，进入玉山镇和济南府城的武烈堂进修，待到毕业之后再返回军中任职。

这些将领自然是不愿意，在这些人看来，刘君韬此举是在夺取自己的兵权！

但是没人敢反抗，三万多天策军兵马、数万京营将士就在京畿，谁敢不听从命令，那就是转瞬即灭的下场！

于是，这些京畿驻军将领只能悻悻的交割了兵马，而后在天策军将士的护送下，分别前往玉山镇和济南府城。

眼见各方进展都时分顺利，刘君韬也是长出一口气，同时刘君韬也相信，经过自己的整编之后，整个京畿的兵马将全部被自己掌控，这为刘君韬日后准备推行新政打下了非常好的基础。

不过，这段时间以来，天顺帝的情况日益恶化，到现在已经水米不进，就连汤药都只能靠宫女用嘴灌进去了。

眼见如此，太子朱见深心中的恨意与日俱增，当刘君韬奏请将原吏部尚书王再新等人问斩的时候，太子朱见深当即下令，将众人由立即问斩改为凌迟！并且诛九族！

对此，刘君韬一点也不同情王再新等人，他们完全的自作自受。但是对于王再新等人的家眷，刘君韬却有些于心不忍，毕竟自己是从后世穿越而来，对于株连九族这样的刑罚，还是有些接受不了。

但是看着愤怒无比的朱见深，刘君韬张了张嘴，还是没有说什么。

刘君韬知道，如果自己开口为王再新等人的家眷求情，朱见深即便再愤怒，也会给自己这个面子，但同时也会造成自己与朱见深之间出现裂痕，这对日后新政的推行非常不利。

冒着新政出现阻力的危险，去救这些人，刘君韬觉得非常不值得，所以也就没有出手。

三天之后，原吏部尚书王再新一党三十余人，连同九族老少上千口，在午门外菜市口被凌迟处死。

当日，菜市口人山人海，刚刚解除戒严的京城瞬间就沸腾了起来，无数的老百姓前去围观，对着这些罪犯高声喝骂，场面十分混乱。

王再新等一党伏法之后，刘君韬见了北镇抚司指挥使门达一面，二人单独谈论了整整一夜的时间，没人知道二人说了些什么。

不过次日早上门达离开刘君韬驻所的时候，整个人都是战战兢兢的，眼神之中充满了畏惧。

从这天起，门达下令北镇抚司招募了大量的人手，而这些人手几乎全都是从山东、山西招募的，门达还特意为自己招募了两个贴身护卫。