小智一行人继续旅行着，途经了小次郎的家，见证了小次郎和他的未婚妻鲁美嘉之间的恩怨情仇。

这天，小智收到了大木博士的电文，给大木博士打了个电话，电话里，大木博士因小智收服了化石宝可梦对小智说了一堆废话，并且告诉小智，大傻谷已经由于化石宝可梦的出现，被联盟重视起来了，未经允许不能通行。而后又和喵喵聊了一会儿，据喵喵报告，小智收服的那些化石宝可梦们把大木博士吓了一跳，最后还是喵喵制作了一个机器人，这才制服了化石宝可梦们。

几天后的路上，波克比也在小霞的期待中诞生了，小霞开心地抱着波克比说道：“好可爱啊！波克比，你好啊！”波克比高兴地叫着“jiaoduigvli！”小霞也收服了波克比，将宝石海星传送到华蓝道馆去了。波克比出生后，皮卡丘就化身为了保姆皮，基本上为波克比操碎了心。

这天，小智一行人碰到了一个背着登山包的大叔，要求进行一场宝可梦对决，小智自然是来着不拒当场派出妙蛙种子，大叔的宝可梦是一只独角犀牛，经过一场战斗后，小智的妙蛙种子快要进化了，痛苦地呻吟着，小智见状，二话不说，抱起妙蛙种子就朝宝可梦中心跑去，小霞和小刚也立刻追上去。

到达宝可梦中心后，时间已是傍晚。乔伊小姐经过一番检查后对小智说：“你的妙蛙种子没事，只是开始出现进化的征兆罢了。”

小智听完，说道：“它没事就好。”小智其实害怕自己的妙蛙种子不想进化，并没有很兴奋，小智很顾及自己的宝可梦们的想法，它们是自己的伙伴，小智尊重它们的决定，虽然小智有时候会给宝可梦们提些建议，如果宝可梦们不乐意，小智是不会去强求的。