坂木带着小智来到一扇由全合金打造的大门口，通过一系列的认证之后，大门缓缓地开启，门后面的火箭队队员们见自己的大老板带着一个十岁的少年，纷纷露出疑惑的表情，坂木集结了火箭队的干部，开始了介绍：“我身后的这位就是我大哥赤虹的儿子——小智！”火箭队的干部们一听，纷纷向小智行礼：“属下参见小智少爷！”

坂木挥挥手，示意他们退下，火箭队的干部就都退下了。坂木对小智说道：“小智，走吧！带你去看看那两只宝可梦。”小智现在明白了，一共有三只梦幻复制体，其中一只在自己的父亲——赤虹的手里，并且还是最原始的超梦，现在的这两只估计是赤虹的超梦克隆体。

小智在坂木的带领下，来到了富士博士的研究房，富士博士见坂木带着一个十岁的少年进来了，赶紧过去行礼：“老板，这位少年应该就是小智了吧？”坂木只是点了点头，随即道：“那两只超梦怎么样了？”富士博士听到这话，说道：“跟我来。”随后就带着坂木和小智来到了三个培养皿前，看到眼前的小爱复制体和两只超梦，小智问道：“怎样才能唤醒它们？”富士博士拿出一块平板电脑递给小智，对他说道：“同时释放超能力，波导之力，常青之力和御龙之力就能够唤醒它们，用平板电脑和它们交流就行。”

小智照做，坂木这时突然下令：“除了富士博士以外的所有人全都撒出去。”其他人照着坂木的命令撒离了实验基地。富士博士问坂木：“老板，小智少爷这一次需要多少时间啊？”坂木看了看小智，回答道：“我也不知道，当初赤虹花了五个月的时间才让那只超梦认可他。”

随着小智不断地释放出四种能力，在超梦的意识空间突然出现一个光团，这个光团渐渐地变成了小智的样子，小智睁开眼睛看了看四周，四周是一个小镇上的景色，天空中有火烧云，应该是黄昏之时。

一个声音传来：“你是谁？”小智看向那个声音的来源，一只幼生体的超梦带着一个小女孩从背后向小智飘来。小智知道这个女孩就是富士博士的女儿——小爱。就在小智打量着小爱的时候，幼生体超梦再次问道：“你到底是谁？”小智回答道：“我是小智。”超梦看着小智，问：“你就是唤醒我的人？”小智点了点头，再次说道：“嗯，我知道有关你的所有，包括这个世界。”

超梦再次发问：“你是神吗？”小智回答道：“不！我可不是神！我是一名穿越者。”超梦又问道：“什么是穿越者？”小智说：“这个问题很复杂。简单地说就是我的前世不是这个世界的人，但是我死亡后魂魄通过轮回来到了这个世界。嗯，这么说你懂吧？”